A Leucemia Mieloide Crônica (LMC) é uma neoplasia caracterizada pela presença do cromossomo Philadelphia (Ph+) ou t(9;22), que resulta no rearranjo dos genes ABL1 e BCR. Esta fusão pode gerar os transcritos [e1a2 e e13a2 (b2a2)/e14a2 (b3a2)] que codificam tirosinoquinase (TK) p190 ou p210.

Este trabalho objetiva relatar um caso com diagnóstico de LMC Ph+ no cariótipo e transcrição reversa seguida por reação em cadeia de polimerase quantitativa (RT-qPCR) para BCR-ABL1 negativa.

M.C.C, feminino, 54 anos, com leucocitose de 35.200/mm3, desvio à esquerda, cariótipo t(9;22)[q34.1;q11.2)[20] e BCR-ABL1 por RT-qPCR negativo.

Diante do RT-qPCR negativo, procedeu-se a reação em cadeia de polimerase convencional (PCR) e sequenciamento de nova geração (SNG) da amostra.

Inicialmente, testou-se a detecção de translocação nos transcritos p190 (e1a2) e p210(e13a2 e e14a2) e o resultado foi negativo. A partir deste resultado, foi feita a PCR convencional que apresentou resultado positivo para p210. Diante da divergência dos resultados (PCR positivo e RT-qPCR negativo), processou-se por SNG que demonstrou dois transcritos raros associados, sendo um o e14a2, localizado no meio do exon 2 (ponto de quebra rara), e o outro, o rearranjo raro e14a3.

Na literatura, estão descritos casos semelhantes ao aqui relatado, principalmente relacionando os resultados de cariótipo Ph+ com RT-qPCR negativo para o rearranjo BCR-ABL1. Em casos de transcritos raros associados, o resultado quantitativo negativo sugere a limitação do método quanto à região de anelamento do primer. Neste caso, a região de anelamento do primer está localizada nas extremidades do exon 2 e um dos pontos de quebra no centro deste exon, inviabilizando a detecção por esta metodologia. Diante disso, graças à realização de duas metodologias, cariótipo e RT-qPCR, pôde-se detectar a alteração pelo primeiro e progredir para investigações adicionais (PCR e SNG) que ofereceram a resposta, qual seja, dois transcritos raros e não detectáveis pelo RT-qPCR. Com relação ao SNG, a sensibilidade da detecção de mutantes, usando um painel de genes, é reduzida já que as sequências são derivadas de células leucêmicas e não leucêmicas. Esta é uma metodologia a ser usada para diagnóstico de LMC em casos de carga leucêmica alta. No entanto, devido ao seu elevado custo em comparação com as demais metodologias existentes, tem sido usada para pesquisas de mutações pós terapias anti-TK para acompanhamento da evolução da doença.

Graças à redundância de métodos para pesquisa de Ph+ usadas no diagnóstico, foi possível identificar o Ph+ pelo cariótipo e as variantes e14a2 e e14a3 por SNG, evidenciando um caso de transcritos raros.