Realização de análises pangenômicas nas espécies do gênero Aggregatibacter, utilizando ferramentas de Bioinformática.

Os genomas foram baixados no banco de dados RefSeq depositados no NCBI (National Center for Biotechnology Information) totalizando 34 linhagens, incluindo 33 do gênero Aggregatibacter e uma do outgroup Haemophilus somnus. Para essas análise, foram utilizados os softwares Gegenees e SplitsTree, para análise filogenômica e filogenética, respectivamente. Já para análises de sintenia gênica, foi utilizado o software Mauve.

Os resultados do Gegenees revelaram consistentes similaridades intragrupais, variando de 75% a 100%, enquanto as intergrupais demonstraram taxas reduzidas, entre 16% e 35%. O SplitsTree corroborou essas descobertas, evidenciando clados e uma notável afinidade genética entre A. aphophilus e A. segnis em comparação com A. actinomycetecomitans. A análise do Mauve identificou mudanças estruturais, como inversões e translocações, indicando dinâmica evolutiva.

As avaliações do Gegenees e SplitsTree demonstraram heterogeneidade gênica, porém com níveis consideráveis de similaridade interespécies. A notável proximidade entre A. aphophilus e A. segnis, em contraste com A. actinomycetecomitans, sugere uma afinidade genética mais estreita. As análises do Mauve reforçam essa dinâmica, destacando semelhanças evolutivas entre clados e sublinhagens. A presença de mutações estruturais, como inversões e translocações, reforça a dinâmica evolutiva e a baixa sintenia gênica.

A aplicação de ferramentas bioinformáticas permitiu uma análise pangenômica das espécies de Aggregatibacter, evidenciando semelhanças intra e interespécies. Essas descobertas oferecem perspectivas valiosas para compreender as relações entre essas bactérias e os genes compartilhados. Ademais, esse estudo possui implicações relevantes na área da saúde, considerando que as Aggregatibacter spp. são patógenos humanos. A proximidade genética identificada sugere a possibilidade de investigações futuras para alvos terapêuticos e vacinais abrangentes para todo o gênero.