A Síndrome Mielodisplásica (SMD) é um distúrbio clonal caracterizado por citopenias, hematopoese ineficaz e risco de progressão para LMA. Evidências indicam que a inflamação crônica e vias imunes aberrantes participam de sua patogênese. A epigalocatequina-3-galato (EGCG), polifenol do chá verde, possui efeitos anti-inflamatórios e antitumorais. Este estudo avalia, via RNA-seq, o impacto da EGCG sobre vias imunes na medula óssea e baço em modelo murino de SMD.

Caracterizar os perfis de expressão gênica induzidos pela EGCG, com foco na identificação de genes diferencialmente expressos específicos e exclusivos da medula óssea ou do baço em camundongos com SMD, destacando especialmente aqueles relacionados à inflamação e à regulação de vias de resposta imune.

Camundongos transgênicos C57BL/6 foram divididos em grupos tratados com EGCG por via intraperitoneal (50 mg/kg) ou oral (250 mg/kg) e controle. Sete amostras biológicas (n = 4 EGCG, n = 3 controles) tiveram o RNA total extraído das células Lin⁻ da medula óssea e do baço. O RNA-seq foi realizado na plataforma Illumina NovaSeq 6000 (2 × 100 pb). A qualidade foi avaliada com FastQC, seguida de alinhamento e quantificação via STAR e Salmon. A análise diferencial foi conduzida no R (edgeR, DESeq2 e Limma-voom), com |log2FC| > 1 e p < 0,05 como critérios para DEGs. Perfis públicos de expressão gênica do Expression Atlas (https://www.ebi.ac.uk/gxa/home) foram usados para comparação, incluindo populações hematopoéticas progenitoras e baço normal de C57BL/6. O enriquecimento funcional (GO e vias biológicas) foi obtido pelo DAVID.

A análise de expressão diferencial identificou 538 DEGs na medula óssea (279 down e 259 up) e 642 no baço (280 down e 362 up), revelando perfis transcricionais distintos. O baço apresentou mais genes upregulados, sugerindo resposta mais intensa ao EGCG. Entre os principais DEGs da medula óssea destacaram-se Trim21, Plcb4, H2- Eb1, Il12a e Tuba1a (up) e Plpp2, Rps6kb2, Cd52 e Gstp3 (down). No baço, Dgat1, Il18, Mmp9, Mpo, Lcn2, Alox5 e Elane estiveram aumentados, enquanto Mapk11, C3, Ikbkg e Il1r1 foram reduzidos. O enriquecimento funcional indicou, na medula, ativação da imunidade adaptativa (“positive regulation of type II interferon production”, “T cell differentiation”, “Th1 and Th2 cell differentiation”) e alterações estruturais (“external side of plasma membrane”, “late endosome membrane”). No baço, predominaram vias inflamatórias e de defesa inata (“neutrophil extracellular trap formation”, “RHO GTPases Activate NADPH Oxidases”, “inflammatory bowel disease”), refletindo infiltração de neutrófilos, aumento de EROs e regulação de citocinas pró-inflamatórias (IL-18, IFN-γ).

O EGCG regulou distintamente os perfis gênicos da medula óssea e do baço em camundongos com SMD. Na medula, ativou vias de interferon tipo II e diferenciação de células T, enquanto no baço intensificou respostas de imunidade adaptativa, estresse oxidativo e inflamação. Esses resultados indicam ação tecidual específica do EGCG, sugerindo alvos imunoregulatórios na SMD.