A leucemia mieloide aguda (LMA) é uma neoplasia caracterizada pela proliferação clonal de células mieloides precursoras. Algumas descobertas da biologia da LMA, recentemente, impactaram na capacidade de diagnóstico, avaliação de risco, monitoramento e no manejo terapêutico dos pacientes. Na nova classificação da OMS (5 edição-2022), a presença de rearranjos entre genes específicos tem proporcionado a divisão da LMA em diferentes subtipos. Algumas fusões são mais frequentes como RUNX1::RUNX1T1, CBFB::MYH11, PML::RARA, DEK::NUP214 além de rearranjos envolvendo o KMT2A que podem ser identificados pelo cariótipo ou por sequenciamento de nova geração (SNG). A caracterização desses rearranjos pode direcionar tratamentos mais intensivos ou alvo específicos.

Avaliar a correlação entre a detecção de fusões gênicas identificadas pelo SNG e cariótipo, de forma concomitante, em pacientes com LMA, tanto ao diagnóstico quanto durante o tratamento, no período de 2021 a 2025. A avaliação de mutações gênicas identificadas pelo SNG, por meio do DNA, foi excluída dessa análise.

O cariótipo foi realizado a partir de cultura de curta duração pelo método de coloração de banda G com análise de 20 metáfases. O processamento do SNG consistiu na extração de DNA e RNA em amostra de sangue periférico ou de medula óssea, submetidos ao sequenciamento na plataforma NextSeq500 (Illumina). Os dados do sequenciamento foram processados pela bioinformática para análise da região de fusão de 27 genes envolvidos em LMA. Neste estudo, foram realizados cariótipo e SNG concomitantes em 49 casos de LMA. Foram identificadas 17 fusões diferentes pelo SNG. A fusões mais comum foram a CBFB::MYH11(26,5%), BCR::ABL1 (22,4%), PML::RARA (12,2%) e cinco, envolvendo o gene KMT2A (10,2%). Na análise do cariótipo, oito casos (16,3%) foram normais, ou seja, os rearranjos gênicos descritos no SNG não foram identificados; em outros quatro casos (8,1%) não havia metáfases após cultura celular para análise. Porém, em outros 16 casos (32%) o cariótipo mostrou alterações cromossômicas numéricas adicionais que não se consegue identificar no SNG. Na análise das duas técnicas, em aproximadamente 75% dos casos, as fusões foram identificadas no cariótipo e SNG.

A análise do SNG tem aumentado o conhecimento de alterações importantes para a classificação, estratificação de risco e direcionamento de estratégica terapêutica nos pacientes com LMA. Por outro lado, o cariótipo contribuiu, nessa análise de dados, com o achado de alterações cromossômicas numéricas adicionais que não foram identificadas por sequenciamento. Em adição, algumas fusões são crípticas, ou seja, não são vistas no cariótipo como o exemplo da fusão KMT2A::ARHGEF12 que consiste na del(11)(q23;q23) identificada em um caso do estudo, mas pode ser identificada no SNG. Portanto, os dois métodos se complementam e devem ser realizados pois fornecem informações importantes para melhor caracterizar a LMA.